Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelpQ01102 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelpQ01102 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms