Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms