Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PrcdQ00LT2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms