Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms