Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pax8Q00288 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms