Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx2Q00262 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx2Q00262 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms