Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psme1P97371 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psme1P97371 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms