Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll3P85442 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll3P85442 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms