Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msx3P70354 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms