Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad54lP70270 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rad54lP70270 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms