Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps3P62908 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms