Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp46P62069 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp46P62069 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms