Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms