Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms