Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d1P61080 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms