Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rin3P59729 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rin3P59729 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms