Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtpaP58389 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms