Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dpf3P58269 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms