Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5bP56480 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5bP56480 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms