Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtskP55097 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtskP55097 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtskP55097 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtskP55097 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms