Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ptpn5P54830 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms