Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms