Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CnbpP53996 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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