Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upp1P52624 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upp1P52624 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms