Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FmodP50608 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FmodP50608 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms