Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpdP50404 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpdP50404 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpdP50404 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms