Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmod1P49813 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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