Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hcls1P49710 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms