Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GdnfP48540 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GdnfP48540 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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