Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prox1P48437 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prox1P48437 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prox1P48437 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prox1P48437 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms