Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Abcd1P48410 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms