Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr7P47774 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms