Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms