Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ItgavP43406 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgavP43406 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 531.8 ms