Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdf7P43029 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdf7P43029 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms