Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Elk3P41971 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Elk3P41971 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms