Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VhlP40338 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VhlP40338 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VhlP40338 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VhlP40338 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms