Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chd1P40201 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd1P40201 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chd1P40201 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chd1P40201 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms