Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fen1P39749 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms