Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Traf1P39428 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Traf1P39428 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms