Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms