Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ddit3P35639 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms