Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nedd1P33215 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nedd1P33215 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms