Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc11P31313 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms