Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfraP26618 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms