Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk11bP24788 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk11bP24788 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms