Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd247P24161 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd247P24161 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms