Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZfaP23607 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms