Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsta3P23591 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms