Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PparaP23204 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PparaP23204 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PparaP23204 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PparaP23204 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PparaP23204 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms